EU-Kommissionen har i 2012 foretaget en undersøgelse af EU landenes implementering af jernbanesikkerhedsdirektivet – et såkaldt pilotprojekt. Kommissionen har i den forbindelse vurderet, at Danmark ikke har implementeret jernbanesikkerhedsdirektivet præcist nok i bekendtgørelse om sikkerhedscertifikat til jernbanevirksomheder. Derfor ændres bekendtgørelsen.